رفع اشکال

• project configuration بارگذاری نمی‌شود: repository را در Codex trust کنید و در صورت نیاز session جدید بسازید.
• Context7 در دسترس نیست: اختیاری است. CONTEXT7_API_KEY را از parent process یا authentication تأییدشده فراهم کنید؛ MCP server جایگزین اضافه نکنید.
• skillهای repository دیده نمی‌شوند: پس از تغییر skillها session جدید Codex ایجاد کنید.
• artifactهای تولیدشده باید پاک شوند: فقط pathهای مشتق‌شده شناخته‌شده را حذف کنید؛ schema، template، catalog، installer، library، prompt، test، docs و agent asset canonical را حذف نکنید.

مشکلات Phase 2

• mount مفقود یک خطای fatal است و نباید با directory داخل workspace جایگزین شود.
• language server مفقود build defect است؛ نصب runtime با npm، uvx، PowerShell module یا downloader fallback مجاز نیست.
• Doctor فقط گزارش می‌دهد و نباید permission، volume یا configuration را repair کند.
• write شدن Serena configuration نشانه config ناقص یا migrate‌شده است و باید validation را fail کند.
• Graphify clean فقط output mount دقیق را می‌پذیرد و symlink را دنبال نمی‌کند.